超级电容器具有十分广泛的用途。与燃料电池等高能量密度物质相结合，超级电容器供给快速的能量释放，满足高功率的需求，从而使燃料电池可以仅作为能量源的使用。目前，超级电容器的能量密度可高达20kW/kg，并现已开始抢占传统电容器和电池之间的商场。要先放电，尤其是电解电容。
在要求高可靠性而对能量要求不高的应用中，能够用法拉电容器来取代传统电池，也能够将超级电容器和电池结合起来，应用在对能量有要求很高的场合，而能够选用体积更小、更经济的电池。将电容器串联运用。因为工艺原因，单极超级电容器的额外工作电压一般在2.8V左右，所以大多情况下有必要串联运用。
超级电容器具有固定的极性。运用前应承认极性。应在标称电压下运用。 当电容器电压超越标称电压时，将会导致电解液分解，同时法拉电容会发热，容量下降，并且内阻添加，寿命缩短，在某些情况下，可导致电容器功能溃散。高频率的快速充放电会导致电容器内部发热，容量衰减，内阻添加，在某些情况下会导致电容器功能溃散。超级电容器生产厂家不可以处于相对湿度大于85%或含有有毒气体的场所。这些环境下会导致引线及电容器壳体腐蚀，导致断路。外部环境温度对运用寿命有着重要影响。电容器应尽量远离热源。
任何超级电容器都会在通电情况下，经过内部并联电阻放电，这个放电电流称为漏电流，它影响超级电容器单元的自放电。超级电容模组的电压在串联使用时也需求平衡，由于超级电容存在漏电流，内部并联电阻的大小决定串联的超级电容器单元上的电压分配。当超级电容器的电压安稳后，各个单元上的电压将跟着漏电流不同而发生变化，而不是跟着容值不同而变化。漏电流越大，额外电压就越小，反之，漏电流小，额外电压就高。
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