超级电容器主要应用于两类储能市场：以铅酸电池站主导地位的汽车及固定能量储存市场和以镍、锂电池占主导地位的消费类电子产品市场。在新能源汽车领域，超级电容器可与二次电池配合使用，实现储能并保护电池的作用。通常超级电容器与锂离子电池配合使用，二者完美结合形成了性能稳定、节能环保的动力汽车电源，可用于混合动力汽车及纯电动汽车。
超级电容器能够很好的应用于这两个市场并且已经在这两个市场中取得了巨大发展。技术的快速进步和成本的降低将使其能够在储能装置市场确立自己第四大（或五大）的地位。在移动通信基站、卫星通信系统、无线电通信系统中，都需要有较大的脉冲放电功率，而超级电容器所具有的高功率输出特性，可以满足这些系统对功率的要求。
超级电容器除了具有高比功率和充电速度快的特性外，在循环使用寿命上也高出化学电池至少百倍，能充电、放电上百万次，可大大节省开支。超级电容器还可以应用于建筑领域的通风、空调、给排水系统中，作为启动装置。另外，法拉电容器还可以应用于电站、变流以及铁路系统中，包括电磁阀门控制系统、配电屏分合闸、铁路的岔道控制装置等。
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